Lancet Oncol:肾透明细胞肝癌与肥胖悖论相关的转录组特征分析

2021-12-06 03:10:08 来源:
分享:
一.分析背景

高血压与肝粉红色细胞核肝癌 (ccRCC)的风险减小有关,但高血压又矛盾地与该的预后有所改善有关,其潜在有效地尚不清楚。现原作者对高血压患儿和短时间BMI患儿在原发和腺周脂肪酸中会的肝脏聚合和免疫转录小组相似之处顺利完成分析分析方法。

本文解说了蛋白质详见达引起的微环境的相似之处有效地暗示高血压患儿的猎食占优(高血压论题)。

二.分析方法流程三.书评请教1.COMPARZ字段、TCGA-KIRC字段、MSK免疫外科手术字段信息收集、调适

在COMPARZ字段的453名患儿中会,有375名(83%)患儿具可视的微阵列信息,外科手术前BMI测量以及无进展和某种程度猎食信息顺利完成分析方法(详见1)。除119名(26%)太重患儿外,来自COMPARZ试制的再度字段之外256名(68%)患儿(n=256)。

详见1.COMPARZ医学试制字段的人口生产量数学方法和医学构造

TCGA-KIRC字段中会的332举例患儿中会,分析了经肝结扎外科手术的152举例(46%)更早(即AJCC III和IV期)ccRCC患儿的医学和人口生产量数学方法信息(详见2)。在忽略59名(39%)太重患儿后,终于获的字段之外93名患儿(n=93)。

详见2.更早粉红色细胞核肝细胞核肝癌TCGA-KIRC字段的人口生产量学和医学构造

从62举例MSK一处脂肪酸字段中会顺利完成肝脏结扎的非乳腺癌粉红色细胞核RCC患儿中会获了原发性和一处脂肪酸样品。在这个字段中会,从59名患儿的PNN(肝周靠近)一处脂肪酸,25名患儿的PNA(临近肝周)一处脂肪酸以及55名患儿的小组织中会取样。在忽略太重患儿后来,再度字段之外41名(69%)PNN样品患儿, PNA样品为17(68%),样品为37(67%)。从在此之前的203名加入者的MSK免疫外科手术分析人这群人中会忽略74名(36%)太重患儿后,总猎食分析方法的再度字段之外129名(64%)加入者(详见3)(n=129)。

详见3. 有别于MSK免疫外科手术的医学试制字段的人口生产量数学方法和医学构造

2.高血压的肝粉红色细胞核肝癌患儿一般而言短时间BMI的肝粉红色细胞核肝癌患儿总猎食期更长

根据KM猎食分析方法,在五小组中会都见到高血压患儿的总猎食期更长。在TCGA-KIRC字段中会,经再行校对后,高血压患儿的某种程度存活期少时短时间BMI小组;在COMPARZ字段中会,经IMDC风险满分校对后,胖患儿的某种程度存活期也少时短时间BMI小组。在MSK免疫疗法字段中会,经IMDC风险满分校对后,BMI与死亡率的无相当大相似之处(如绘出1)。

绘出1.TCGA-KIRC字段 (A)、COMPARZ 字段(B)和MSK免疫外科手术字段(C)的总猎食期

3.COMPARZ字段中会高血压患儿具更多的PFS

对CPMPARZ字段KM分析方法后,KM曲面揭示,COMPARZ字段中会高血压患儿比短时间BMI患儿具更多的PFS。

绘出S1.COMPARZ字段中会高血压患儿比短时间BMI患儿具更多的PFS

4.使用一线药物外科手术,高血压患儿仍具更多的OS

KM曲面揭示了在使用一线过氟化物转移酶抑制剂(pazopanib或Sunitinib)的两个外科手术小组中会,高血压患儿的OS基本上较短时间BMI患儿好。

绘出S2.COMPARZ字段使用一线药物外科手术小组的总猎食期分析方法

5.COMPARZ字段中会,高血压与短时间BMI的患儿转录小组蛋白质构造依赖于相当大相似之处

做完上述分析方法,原作者在三个字段中会确认高血压论题依赖于后来,接下来在COMPARZ字段中会对高血压和短时间BMI患儿分析了转录小组学相似之处。先是做了Hallmark蛋白质集的GSEA分析方法,尤其高血压患儿与短时间BMI患儿相互间的相似之处:高血压患儿中会揭示氧气、TGF-β、上皮-间充质转变和肝脏聚合频谱途径相当大上调,提示伤口愈合种系统的应答(绘出A)。绘出B是对绘出A审核的几个蛋白质详见达途径的Enrichment plots。

绘出S4.COMPARZ字段中会高血压患儿与短时间BMI患儿的ccRCC转录小组蛋白质构造依赖于相当大相似之处

6.COMPARZ字段与TCGA-KIRC字段 中会高血压比短时间BMI患儿的肝脏聚合满分高

在GESA独有的构造蛋白质集肝脏聚合满分尤其中会,高血压患儿高于短时间BMI患儿(如绘出2)。

绘出2.COMPARZ字段(A)与TCGA-KIRC字段 (B)中会高血压原发患儿与短时间BMI患儿的肝脏聚合的z score

7.短时间BMI与高血压患儿的免疫这群人无相当大相似之处

对短时间BMI(7举例)与高血压(16举例)患儿的原发的主要免疫生产量均有别于流式细胞核术顺利完成分析。绘出A揭示了高血压患儿与短时间患儿相互间的免疫这群人的某种程度相似之处。绘出B清楚揭示了高血压和短时间BMI患儿T细胞核这群人的灌注程度。见到短时间BMI与高血压患儿的免疫这群人无显着相似之处,免疫灌注的程度与BMI无关。

绘出S9.用流式细胞核术分析方法短时间BMI与高血压患儿的免疫这群人无显着相似之处

8.与短时间BMI患儿相对于,高血压患儿腺周脂肪酸黏膜减小,尤其是靠近的腺周脂肪酸

在MSK的非乳腺癌ccRCC患儿的基础性字段中会,原作者合并了20个最相当大的丰富的IPA规范途径,这些途径来自于高血压和短时间BMI患儿的PNN和PNA样品的尤其(绘出A)。高血压和短时间BMI患儿的PNN和PNA样品相互间的免疫灌注(ssGSEA满分)尤其(绘出B)。

绘出S5.与短时间BMI的患儿相对于,高血压患儿的肝周脂肪酸揭示出黏膜和氧气减小

综上,在COMPARZ试制字段中会,经过IMDC风险满分调整后,见到一般而言短时间BMI患儿,过氟化物转移酶抑制剂外科手术提高了高血压患儿的猎食率,特别是做sunitinib外科手术的患儿。IMDC风险满分模型包含的小组分间接反映宿主考量对肝癌症不足之处黏膜作用(举例如贫血,中会性粒细胞核增加,和血栓增加症),这些考量或许也是免疫外科手术结果和BMI相互间关联有效地的原因。见到高血压患儿的肝脏聚合点数高于短时间BMI患儿,与之前其他的分析结果详见明的,加入肝脏聚合,β-氟化种系统等等蛋白质的富集的成因原则上。因此,肝脏聚合的相似之处可以部分暗示高血压患儿做过氟化物转移酶抑制剂外科手术后的较好预后。

此分析为高血压论题提供者了生物学拥护。在抑郁症ccRCC的患儿检视到高血压患儿一般而言短时间BMI的患儿微环境的相似之处:特别是高血压患儿的的肝脏聚合减小,但某种程度黏膜无显着相似之处。值得注意的是高血压患儿的一处脂肪酸揭示减小的黏膜和氧气状况。粉红色细胞核肝癌与腺周脂肪酸微环境的复杂作用力或许具医学意义,值得进一步分析。

原始出处:

Sanchez A, Furberg H, Kuo F, Vuong L, Ged Y, Patil S, Ostrovnaya I, Petruzella S, Reising A, Patel P, Mano R, Coleman J, Russo P, Liu CH, Dannenberg AJ, Chan TA, Motzer R, Voss MH, Hakimi AA. Transcriptomic signatures related to the obesity paradox in patients with clear cell renal cell carcinoma: a cohort study.Lancet Oncol. 2020 Feb;21(2):283-293

分享:
瘦脸针品牌 无假体隆鼻多少钱 上海天大医疗美容医院 东莞美立方整形美容医院 上海时光整形外科医院 美容整形 365整形网 整形医院哪家好 整形医院排名 整形医院咨询 整形专业知识 济南整形医院