在手胃癌在必先的感染率呈逐年上升的趋势，世 界卫生有组织国际癌症研究机构(International Agency for Research on Cancer，IARC)数据显示，必先 2020 年在手直 肠癌的最初发眼疾例数为 56 万例，因在手胃癌死亡眼疾例多达 29 万例 。 约 25%的在手胃癌极高血压在临帷时已出现数倍 处移往，此外，25%的极高血压在治疗操则有过程里发生移往，中后期 极高血压预后偏极高，5 年生存率不膝 15%。 分子标志物侦办 测定是挑选核酸治疗获益人群的前提，近年来随着侦测定 核心技术的飞速发展，极高热辐射碱基，也称为下一代碱基( next generation sequencing，NGS)，因其在热辐射、成本及效率 等层面的财金合优势，在等位基因功能性状侦测定里展现出得越 来得越广阔的应当用机遇。 然而 NGS 侦测定核心技术流程复杂， 对测试四楼自然环境前提条件、其他部门能力及数量级经营管理拒绝极高，任何 一个环节出现问题，均会影响侦测定在手果的准确功能性，进而影响医学决策。
为保证医学外科工则有的准确功能性和规范功能性，本共识由医学护理人员在手合在手胃癌实际外科均需求发起，先为内诸多侦测定公司策划，眼疾理及侦办验研究员指导，从在手胃癌 NGS 侦测定的医学并不一定及测试四楼流程质控并不一定主导制定华北地区研究员共识，以指导 NGS 侦测定核心技术在在手胃癌外科里的规范应当用。
1，生物标志物在在手胃癌里的医学内涵
目前为止较恰当的肠癌就其遗传功能性疾眼疾主要有 3 类:Lynch 财金合征、家族功能性腺瘤肉眼疾 ( familial adenomatous polyposis，FAP）和黑斑息肉眼疾（P⁃J 财金合征）。 同时《华北地区医学总会 ( CSCO) 在手胃癌外科最最初 2020 版》 针对遗传功能性在手胃癌筛查和等位基因临帷订立了应当。
FAP 录用展开 APC 位点碱基/片段缺失碱基，有功能性状提示 FAP 或衰减同型 FAP(AFAP);无功能性状 则录用先为 MUTYH 位点碱基 / 片段缺失碱基，有躯 不定提示 MUTYH 就其息肉眼疾(MUTYH⁃associated pol⁃ yposis，MAP)。 对于无任何已确定的息肉眼疾财金合征等位基因 的致眼疾功能性功能性状，正因如此多等位基因功能性状侦测定，多等位基因 Panel 应当之外所有息肉和在手胃癌就其等位基因。
在手胃癌里类似于 TMB 判读原理及侦测定范城外汇总
TMB 侦测定更容易尽力挑选免疫治疗潜在获 益的极高血压，显著大幅提极高中后期恶功能性极高血压的事实后下 解率和总生存期。 MSI⁃H/dMMR 通常也特别是在 TMB⁃H，MSI⁃H 抽样则有约 83%表现为 TMB⁃H，且有 97%的抽样 TMB≥10 Muts/ Mb。 在医学研究和在实践中操则有过程里，TMB 的评量判读标准规范 在不尽相同癌种里不存在差异，而不尽相同核酸碱基 Panel 的 TMB 侦测定体系之间 TMB 阈值无法通用。
极高血压订立就其治疗方案的操则有过程，在手合在手胃癌生物标志物就其医学内涵，建言侦测定则有如下录用 ：
2，抽样处置及河运
FFPE 抽样为保证碱基数量级，手术或活侦办
有组织应当在离体 30 min 内浸入到 100 ml 的 4%甲 羟基溶试管里展开比较简单，能避免运用于酸功能性及含有重金属 氯离子的比较简单试管。 其里，大标本比较简单一段时间为 6 ~ 48 h，不最多 72 h;小活侦办体可比较简单 6 ~ 12 h。 对 其里 1 张 FFPE 抽样展开切片染色，并在显微镜 下观察细胞的酸度和数量。 若酸度不 膝，则测试四楼无均需对通过富集后相符数量级拒绝的 标本展开评量，或者制备成 FFPE 肿瘤学蜡块后 展开碱基萃取。 值得注意的是，组织起来 NGS 侦测定前 应当通过 HE 染色评量细胞酸度，至少考虑到肿 瘤细胞酸度在 20%以上。
手术或活侦办的最初鲜有组织抽样
最初鲜有组织可萃取到极高数量级的碱基。 最初鲜有组织应当在离体 30 min 内 将其遗留于试管氮罐或者-80 °C 冰山箱里，防止 RNA 等 碱基降解。 如均需评量细胞酸度，可采用浓缩切 片碱基原理，若细胞酸度不膝，可通过标识 区域展开富集。 最初鲜有组织可在试管氮、-80 °C 冰山 箱或稳定剂里长期遗留。
血清抽样
对于不存在于血清里的气化 DNA， 即 ctDNA，取样时可运用于专用的 ctDNA 遗留管采血， 采血后轻柔颠倒 8 ~ 10 次，确保采甲状腺里的 ctDNA 遗留试管与血试管气化适当混匀，气态河运遗留即可，公然 冻融血试管气化;到多达测试四楼后，分离血清，萃取游离 DNA[26] 。 也可运用于一次功能性 EDTA 抗凝真空采甲状腺， 通过观察 8 ~ 10 ml 全血，冰箱货物运输，2 h 内分离血清，提 取游离 DNA，如均需遗留，请求安放-80 °C 冰山箱里，并避 免反复冻融。
抽样运送去规范
送去标准规范操则有规范( SOPs) 以确保运送去操则有过程里各类样 本的安全功能性和操则有过程的可控功能性(详见第 4 节)。 石蜡 材料可以气态货物运输，血试管气化抽样无均需在干冰山前提条件下运 输，碱基抽样均需在 4 °C或浓缩前提条件下货物运输。
3，调查刊告阐释及标准规范巨集
NGS 医学调查刊告包含具体内容
等位基因侦测定的医学刊 告应当当之外:(1)根基数据:测试四楼英文名称、测试操 则有其他部门、调查刊告审定其他部门、联系方式。 (2)受侦办者的 基本数据:应当之外受侦办者姓名、功能性倾向、出生月份、 接受侦测定的月份、侦测定的借此和受侦办者的医学指 征等。 (3)抽样的数据:抽样类同型，如 DNA、外周血、唾试管、最初鲜有组织、FFPE 有组织等;通过观察一段时间和采 集口部、抽样编号、送去侦办一段时间、侦测定调查刊告一段时间和样 本主要质控情况，如 DNA 数量级评量以及碱基质 量评量等。 (4)侦测定项目:等位基因 Panel 的侦测定位 点及 侦办 测定 范 城外、 侦办 测定 仪 器、 侦办 测定 试 剂， 是 否 为 NMPA 批准运用于的侦测定盐酸以及 NMPA 获批的 等位基因基因座数据，或测试四楼自建侦测定( laboratory de⁃ veloped tests，LDTs) 盐酸、侦测定原理、侦测定范城外、侦办 测定下限(LoD)等。 (5)侦测定在手果及功能性状阐释:对 等位基因功能性状的侦测定在手果展开阐释，如查出的等位基因 同型、功能性状在手果、碱基不定化情况、侦测定在手果的致眼疾 功能性评定、类固醇数据及医学内涵、功能性状阐释引用的 参照历史文献等。 (6)标示侦测定原理的测试四楼内部验 证在手果，侦测定局限功能性及不确定功能性，促使侦测定的 建言。
等位基因功能性状的名为
对等位基因功能性状的描述应当遵循 一定的应当和规范，录用运用于人类等位线粒体功能性状协会 名为最最初(www.hgvs.org)，特异性本的选择建言采用等位基因座参照等位线粒体脱氧核糖碱基在线( Locus Reference Ge⁃ nomic， https:/ /www.lrg⁃sequence.org) 界定的特异性本或者多个国际在线当今的主要特异性本。 对遗传功能性在手胃癌就其等位基因功能性状的说明，建言以旧金山医学遗传学学院( American College of Medical Genetics and Genomics，ACMG;https:/ / www.acmg.net)最最初为标准规范，在侦测定在手果里列举具体的功能性状基因座数据，之外等位基因英文名称、所参照的人类等位线粒体正式版、特异性本参照脱氧核糖碱基正式版、核苷酸功能性状、功能性状、位点 / 外显子序号、等位等位基因杂合功能性、碱基编号及坐标系等等。
医学内涵的阐释和批注
对于细胞核功能性状，采用评定处置的方式 财金合特别是在临帷、医学最最初、在线或历史文献结论，可 以将细胞核等位基因功能性状可分医学内涵恰当(I 级)、有潜在医学内涵(II级)、医学内涵不恰当(III 级) 和良功能性或可能良功能性功能性状( IV级) 。 测试四楼无均需建立联系分类法及评定和调查刊告的 SOPs，SOPs 应当至少之外两 个层面:(1) 对细胞核等位基因功能性状展开评定的流程; (2)在日常侦测定里调查刊告哪一级或哪几级功能性状基因座。 评定的流程应当有记录，之外结论就其联的最最初、历史文献、 在线、结论等级、评定在手果等。 医学结论决定躯 不定基因座评定，可根据《极高热辐射碱基核心技术医学规范化 应当用广州研究员共识》发表的细胞核功能性状基因座和临 帷结论可分以下 4 级。
对胚系功能性状的侦测定
除了里外外科最最初及 不可忽视参照历史文献外，另有 Online Mendelian Inheritance in Man (http:/ /omim.org)和旧金山 ACMG 可参照。 ACMG 最最初将功能性状基因座致眼疾功能性的等级可分致眼疾、疑 玲珑致眼疾、医学内涵未明、疑玲珑良功能性和良功能性 5 个等级。 调查刊告里应当列举与遗传功能性在手胃癌(如 FAP、Lynch 财金 合征等)就其的致眼疾以及疑玲珑致眼疾功能性状，并对功能性状 的致眼疾功能性展开分析阐释[28] 。
内涵有异基因座的处置
无论是细胞核 功能性状，或是胚系功能性状，都不存在内涵有异基因座。 测试 四楼均需订立就其政策用来确定是否调查刊告或者不调查刊告 医学内涵有异的基因座，并附上说明和参照在线， 并且要在调查刊告里注明本测试四楼出具医学调查刊告的 规则。
DPYD 侦测定在手果
里等代谢同型极高血压，应当基于 活功能性分值增极高起始副则有用;慢代谢同型应当能避免运用于氟尿N- 啶及其前体类固醇。 UGT1A1 侦测定在手果里，UGT1A1∗28 和∗6 为纯合功能性状同型或双杂合功能性状同型的极高血压应当增极高 伊立替康的副则有用，录用副则有用为 150 mg / m2 。
偏极高丰度功能性状在手果的处置
对抽样展开 NGS 侦办 测定时如出现较偏极高丰度的功能性状在手果( 通常眼疾毒学抽样偏极高于 5%，血试管气化抽样偏极高于 1%或偏极高于侦测定 LoD)时，建 议财金合评量 NGS 测试平台功能性能、碱基深度以及 细胞数目等因素财金合考虑。 特别对于核酸治疗相 关的等位基因建言运用于其他侦测定原理展开促使验证 确认(如 Sanger，dPCR 等)。
坚称首肯
建言提供极高血压手写或者在线版的坚称书。
调查刊告巨集
测试四楼应当根据侦测定项目，假定并不相同当 的侦测定调查刊告巨集(表 7)，并形成 SOP 文件。 巨集里 应当恰当列举侦测定调查刊告里应当提供的数据，如极高血压基本 数据、抽样数据、侦测定数据、侦测定在手果、在手果断言、实 验四楼数据、侦测定原理的局限功能性以及其他具体内容等。
原始来历
华北地区抗癌协会核酸治疗专业委员会.在手胃癌分子侦测定极高热辐射碱基华北地区研究员共识 .医学学杂志 2021 年 3 月第 26 卷第 3 期 Chinese Clinical Oncology，Mar. 2021，Vol.26，No.3
