Cell | 核糖激活或抑制状态决定了核小体分离的差异性

2022-01-10 02:27:27 来源:
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肝细胞结构设计通过倡导或减缓该结构设计的表型可以操控原核生物组的基本功能和细胞身份认定。这些肝细胞结构设计中的不存在特定的核酸翻译后润色(posttranslational modifications,PTMs),它们与特定表型精神状态具体,并可倡导减缓性等位基因结构设计的形成,影响原核生物的表达。为了在有丝分裂时直到现在保持表型程序的完整性,决定肝细胞结构设计的分子可并不相同之处也需要在子代细胞中的建起。建起并不相同类型肝细胞精神状态的关键性决定因素是核酸PTMs,;大要不存在于核酸H3和H4的尾巴上。因此,在有丝分裂的来得进一步中的,除了DNA解码,杂交核小体也需要改建,并分派到子代细胞中的。确实,学术研究辨认出杂交的经典核酸(比如解码依赖的核酸)会在解码叉后不断重新组装。并不相同的学术研究团队辨认出H3K9me3和H3K27me2/3可通过胎盘表现型。然而,这两个核酸润色都是与减缓性肝细胞结构设计具体。那么,杂交中的的核小体,以及它们携带的核酸PTMs是否都能表现型到子代细胞有所并不相同的原核生物一层楼上呢?来自纽约大学兰戈恩医疗机构的Danny Reinberg教授课题组在Cell刊发学术研究Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication,该学术研究辨认出在DNA解码时,启动时与所致减缓肝细胞周边的核小体分立是并不相同的。所致减缓肝细胞结构设计中的的核小体会被安置在子代细胞有所并不相同的原核生物周边,而启动时型肝细胞结构设计中的的核小体的分派则是弥散和随机的。为学术研究核小体的分立状况,学者在候选原核生物一层楼不可逆的标明核酸H3.1和H3.2,以小鼠胎盘骨髓中的核小体在有丝分裂时的改变。简单来说,该新方法通过邻近所致体标明技术,依靠CRISPR为特定原核生物一层楼的H3.1和H3.2带上NAD标明,经ChIP-qPCR检测该NAD标明在细胞周期G1期和S期的总质量,以自由基核小体的分立状况。若该原核生物座H3.1和H3.2上的NAD标明在一次有丝分裂后减少一半,概述该核小体被安置在了两个子代细胞的有所并不相同原核生物一层楼上;若该NAD润色很快消失,概述子代细胞不曾表现型该原核生物一层楼的核小体。学者首先检测了在胎盘骨髓中的沉默表达的Hoxc6, Ebf1, Meis2原核生物的核小体分立状况。这些原核生物一层楼的核小体NAD素质随有丝分裂逐渐差不多,这指引所致减缓的原核生物一层楼的核小体会被安置在子代细胞的有所并不相同位置。这与可知辨认出的H3K9me3和H3K27me2/3可通过胎盘表现型的现象相比拟。那么,启动时型肝细胞周边的核小体又是如何分立的呢?学者检测了在胎盘骨髓中的被启动时表达的Ccna2, Nanog和Pou5f1原核生物,辨认出该原核生物一层楼的NAD标明在有丝分裂后呈弥散精神状态,总质量较低,这指引对于启动时型肝细胞周边来说,杂交核小体很难精准的分派到子代细胞相应的原核生物一层楼,而是随机分派的。来得有趣的是,在抑止胎盘骨髓分化时,Hoxc6原核生物由减缓转变成启动时,它的核小体分派模式也由精准的同原核生物座分派改为随机分派。这概述杂交核小体的局部分派,可以反映该肝细胞周边的活性精神状态。总的来说,该学术研究通过CRISPR指引的核酸NAD标明系统,学术研究了核小体在有丝分裂来得进一步中的的幂,并辨认出启动时与所致减缓的肝细胞周边的核小体幂的并不相同。相比较的是,在细胞周期的S期中的,所致减缓的肝细胞周边的解码要晚于启动时型肝细胞周边。这个时间差异也造成经常肝细胞的解码速度少于异肝细胞。异肝细胞相对较慢的解码低速意味著保证了核小体的精准分派,而经常肝细胞中的的PTMs则由相应的;大缓冲系数(master regulators)实际上标识相应DNA脱氧核糖核酸,并招聘PTMs酶重新建起。原始出处:Escobar TM1, Oksuz O1, Salda?a-Meyer R1, et al.Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication.Cell. 2019 Oct 31;179(4):953-963.e11. doi: 10.1016/j.cell.2019.10.009.
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