Sci Adv：没有证据支持哺乳动物里面细菌表观遗传标记的存在

导言：在晚期阶段，自然界就开始了在不偏离酵母菌肝细胞DNA秘密组织顺序的前提下来使其DNA发挥完以外相同的功能，而这就是通过给DNA亚基上填充无机化学标记来借助于的。DNA甲基化是灵长类的关键表观遗传机制，其中的5-甲基碱基（5mc）是最常见的DNA结构上之一。6mdA是酵母菌受到前提条件结构上系统的基本组成成分，目前在灵长类中的缺乏据信的受到前提条件结构上系统。先前有不少数据分析报道，6mdA也不存在于灵长类中的，但并无证明大力支持。

近日，在《自然科学进展》上的一项数据分析中的，瑞典林雪平医学院的数据分析部门表明，灵长类肝细胞中的不存在酵母菌表观遗传标记很不太可能被污染物了，并且很难足够的证明来推论灵长类中的不存在这种结构上。

N6-甲基甘氨酸（6mdA）是酵母菌中的广泛的DNA结构上，但最近在灵长类DNA中的也得到了连续性。然而，数据分析部门写道，即使对来自相同灵长类肝细胞子类的DNA进行的6mdA谱图和丰度探测数据分析也不赞同。

为了再进一步阐明6mdA在灵长类谱系规格中的的效用，数据分析部门利用了体外将人类固执T特别设计（NTH）肝细胞分化为TH肝细胞亚群的能力。但是，与先前的数据分析忽略，他们找到TH分化更再进一步中的6mdA的丰度很难以外局变化，并且通过观察到分化的T肝细胞中的的6mdA准确度与未有甲基化的以外遗传物质扩增DNA相同，这表明6mdA并未有以可检测的准确度不存在人类T肝细胞中的。

他们还分析了从六个人类肝细胞系中的分离借助于的DNA中的的6mdA，并鉴定借助于两个不具备高于背景阻尼准确度的6mdA准确度的肝细胞系。借助于乎意料的是，两种分开的293T肝细胞系培养物不具备完以外相同的6mdA准确度，这表明数据分析部门通过观察到的6mdA信号并非肝细胞子类本身固有的。无论如何，当他们再进一步看时，他们找到两条6mdA准确度升高的肝细胞系被真核细胞种属污染物，真核细胞种属一种常见的酵母菌肝动物细胞物中的富含6mdA的气溶胶。当他们用真核细胞特异性类固醇Plasmocin处理方式肝细胞系时，6mdA信号降低为A复数对照。

“我们似乎通过这些应用检测到的6mdA'信号'只是阻尼。但是，由于一些复杂的应用问题，几种原理中的的背景阻尼不是随机的，而是真实信号。”高级作者Colm Nestor（尼尔瑟·内斯特）在一份声明中的感叹。

数据分析部门分析了以前通过DNA免疫沉淀测序、质谱和单分子会实时测序在灵长类肝细胞中的取向或检测6mdA的努力。人们找到每种原理都有局限性或弱点，使表观遗传标记的假中性找到率极好，似乎表明林雪平数据分析部门认为不不存在这种现象的证明。

这组作者写道：“我们推论，RNA和酵母菌污染物、免疫交错反应性和其他应用受到限制的紧密结合已导致6mdA在灵长类DNA中的的反复错误识别。随着DNA和RNA结构上家族的不断放缓，以及以前未有知结构上的丰富性越来越常见，即使用到多种相辅相成原理，我们也强调了错误找到的不太可能。我们建议用到结构上和未有结构上的遗传物质DNA标准作为今后对稀有DNA结构上的数据分析的最低要求，以及在用到前更以外面地推论免疫特异性。”

内斯特补充感叹，数据分析部门在数据分析非常常见的现象时必须非常小心，必需用到哪种原理，并慎重考虑他们是否真正在衡量标准不存在的一个人。他感叹：“现在我们可以毫无疑问地感叹灵长类中的不不存在6mdA。关于6mdA，如果数据分析部门暂时中止数据分析无论如何不不存在的东西，则可以节省大量整整和金钱，并且不必要了很多引人不快的一定会。”

原始借助于处：

Karolos Douvlataniotis, Maike Bensberg, Antonio Lentini, et.al. No evidence for DNA N6-methyladenine in mammals. Science Advances 18 Mar 2020: Vol. 6, no. 12, eaay3335